华为云深度赋能基因行业 助力基因测序快速成长

连年来,基因测序技能在基本研究和临床应用等规模都获得了普及的应用, 跟着技能的不绝成长和测序市场的不绝类型化,中国基因测序市场增速明明,进入快速成持久,已成为环球NGS(next-generation sequencing)市场的大本营之一。2007-2017年,中国基因测序行业市场局限增速高于环球整体程度,年均复合增速高达47.5%;2017年市场局限打破了70亿元。据中商财富研究院展望,2022年这一数字将打破150亿元。跟着应用于基因测序的技能日渐成熟,将来十年将是基因组贸易模式成熟的“黄金十年”。

跟着大数据与生命科学的不绝融合,生命科学财富正在产生剧变,“精准医疗”变为实际,基因测序发生的海量数据的处置赏罚成为新的挑衅,慢慢上云成为数字生命期间势在必行的设施。

切脉基因行业痛点, 算力才是要害

当前,基因测序的事变重心已经从序列读取转向数据处置赏罚,基因数据说明息争读是相关到基因测序成长和精准医疗应用的要害环节。可是,今朝基因测序的数据说明也存在许多灾点,譬喻:算力无法弹性匹配、主机运行服从难以晋升、海量数据存储共享实现坚苦等,在必然水平上阻碍了临床应用的成长。

基因数据量局限不绝扩大,大量数据分手在差异的国度、都市、医院,缺乏同一性。这样分手、游离状态的数据倒霉于大数据指导下的精准医疗研究。数据统合和共享是阻碍基因测序数据临床转化的一个难点。

今朝的数据缺乏尺度化,在许多环境下,即即是统一家医院,因为生物测序装备、软件乃至流程差异,数据情势城市截然不同。“当我们把这种数据放在一路,会呈现体系性的毛病。”业内从颐魅者暗示,“尺度化所指的不只是分子数据,也包罗患者的个别信息、用药和愈后随访。这些数据信息的同一和必然水平的共享,必要获得办理。”

现阶段,基因测序的应用照旧首要齐集在无创产前检测和肿瘤诊断治疗两个规模,在临床方面并未普及应用,跟着应用的越发普及,对麋集计较和海量数据处置赏罚手段也有更高的要求。

云计较正是办理基因检测行业痛点的强盛器材,跟着5G期间的光降,云计较将在保障海量数据的计较、存储和说明的同时,带给基因测序行业更多也许。

以华大基因与华为云的相助为例,两边施展各自上风,华大基因的焦点营业体系迁徙上云,堪称是云计较在行业内应用落地、技能真正处事于社会的规范。

华为云联袂华大基因 助力行业成长

华大基因科技处事测序过许多伟大基因组,单一规格的计较资源无法满意营业需求,云计较提供的可供机动选择的计较资源是最好的选择。

线下集群架构不支持高通量的计较(多使命并行),超算测试过之后也无法办理高通量计较题目(首要题目是测序软件针对云计较的优化)。面临这个题目,华为云操作基因容器技能,对客户常用的软件举办了优化,为华大基因提供了云端基因测序办理方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。

2018年,华为云推出了环球首家基因容器处事GCS(GeneContainer Service),基因容器处事是业界首个基于Kubernetes平台,团结Docker容器技能打造的基因测序云处事,基于轻量级的容器技能,团结大数据、深度进修算法,为测序厂商提供了机动可定制的测序流程、秒级可伸缩的高靠得住资源和便捷一站式用户体验,让基因测序数据的计较更省、更快、更轻松。华大基因行使华为云技能后运行周期大大镌汰。

华为云基因测序办理方案架构/来历:华为云官网

云技能在基因测序行业中饰演奈何的脚色?

在基因检测规模,对付收罗的基因样本举办数据说明和处置赏罚必要大量的计较资源。基因测序公司必要复杂的算力支持;生命科学的研究比赛,许多时辰已经酿成了一场算力的比拼,大的科研成就凡是是基于复杂的数据。此刻的产前检测、肿瘤检测等医疗检测也会耗损大量的算力。以上这些基因测序对算力的需求都是颠簸的,每每Q4的耗损最大而Q1起码,同时对付差异生物的基因组,必要的算力也差异,这就会扳连到计较集群的扩缩容,传统的线下计较集群是做不到快速的扩缩容的,这就是行使云计较的便利性。

针对基因测序行业,华为云专门为客户定制了多种高度整合的基因测序办理方案。相对行业中传统行使的HPC高机能计较集群,基因容器处事有着明明的领先上风:资源调治更机动,计较可以按需伸缩,使命流程利便自界说,容器更易维护进级等。

云计较助力基因测序快速成长和技能创新

通过华为云与华大基因的相助案例,我们可以清楚的看出,华为云可以镌汰运行周期,进步计较服从和数据储存手段,收缩陈诉周期,保障海量数据的计较、存储和说明等,带给基因测序行业更多也许,为基因测序行业插上新的同党,将算力施展到极致,可以更快、更多的举办生物信息说明,拓展应用规模,助力精准医疗更快的成长。

对付基因测序行业来说,有着最好的成长机会,但也面对着庞大的挑衅,这个挑衅就是怎样做到测序更快、说明更快,更重要的是技能创新更快,通过团结云技能、人工智能、5G等新技能将为行业带来了全新动力。只有这样,企业才气在竞争中脱颖而出,整个行业也才气顺应精准医疗的成长速率,以科技造福将来。